简介:
玛雅实验室
差异表达基因的鉴定是从基因表达谱研究中提取知识的重要步骤。来自微阵列和其他高通量技术的原始扩增数据存入基因扩增综合 (GEO) 并作为文本中的简单综合格式 (SOFT) 文件使用。然而,从 GEO 中提取和分析差异表达的基因需要大量的计算技能。
GEO2Enrichr 是一个浏览器扩展,可用于从 GEO 中提取差异表达的基因集,并通过用户界面使用 Enrichr 分析这些集。 GEO2Enrichr 为 GEO 网页添加了功能,用户只需单击一下,就可以将两组样本提交到我们的网络服务器。服务器下载 SOFT 文件,解析、清理和标准化数据,识别差异表达的基因,然后将生成的基因列表通过管道传输到 Enrichr 进行下游功能分析。 GEO2Enrichr 可以帮助研究人员在没有技术开销的情况下快速探索假设,通过自动化从主要存储库 GEO 中提取知识所需的数据处理步骤,降低生物学家的进入门槛。
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